整个长江水系，包括各附属湖泊，共分布有鱼类350种，其中终生在淡水中生活的纯淡水鱼有324种之多，大大超过我国其他江河的淡水鱼种类数(珠江有淡水鱼239种，黄河仅有150种)。长江的鱼类中，有10种是过河口洄游性鱼类，如降河洄游的鳗鲡、松江鲈，溯河洄游的中华鲟、鲥鱼等；另外还有16种是主要在河口区咸淡水生活的种类，但在下游的淡水中经常可寻觅到它们的踪迹，如鲻、suo、花鲈等。至于偶尔在河口见到的海产鱼类，就不能算作长江的鱼类了。
长江水域的鱼类很多，大约有350种左右。淡水鱼的总数远超我国的其它水系，共有324种。除此之外，还有10种过河口的洄游性鱼类，以及16种在河口生活的咸淡水鱼类。主要的鱼种有中华鲟，银鱼，鲥鱼，鮰鱼等等。其中中华鲟是长江最大的鱼，有长江鱼王的美称。
2019年在长江流域水生生物资源及生境状况公报16日在武汉发布。公报显示，长江原有野生鱼类435种，经过农业农村部长江办连续4年调查发现，已有130多种不见踪迹。
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